序一序二序三总论伤寒热病总论验舌色论验口唇论验二便论辨脉论南北方宜发表不同论南北方宜清里相同论三阴经热病论三阴经寒病论阴症似阳论阳症似阴论宜发表论忌发表论宜清里论忌清里论宜和解论忌和解论宜吐法论忌吐法
自叙跋卷首六经解六气解营卫解风寒解传经解里气解卷一·太阳经风寒原委提纲 (卷一)太阳中风桂枝汤证太阳伤寒麻黄汤证太阳风寒两感桂麻各半汤证太阳风寒大青龙汤证衄血太阳伤寒小青龙汤证太阳风寒白虎汤证太阳伤寒
序一序二自序跋凡例太极图（图缺）命门水火图（图缺）五气图（图缺）卷之一医论命门水火图说五气图说论膀胱者州都之官津液藏焉气化则能出矣论补脾补肾治血贵静广嗣方论论诸痿胃气当察辨利痢脉病之殊治病求本驳诸家痨
序一序二医之可法为问卷之一医学指南总诀二首卷之一本草第一药本五味一首药性指掌九十首妊娠服禁引经药报使六陈十八反(二首并出儒门事亲)十九畏(一首)用药法象(一首)卷之二脉诀第二诊脉入式(一首集次王适斋等
石山医案
医方简义
顾序慎柔师小传师训题辞卷一师训第一历例题辞卷二医劳历例第二虚损门题辞卷三虚损第三脉法损脉致病次序损脉损症治损法五脏逆传致病诀虚损死证寒热论五脏致伤虚损致病之由亢则害承乃制论虚损误药之辨虚损秘诀损病汤药
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
易牙遗意
总论出产择地土收采按时月藏留防耗坏贸易辨假真咀片分根梢制造资水火治疗用气味药剂别君臣四气五味七情七方十剂五用修合条例服饵先后各经主治引使用药法象卷之一草部上人参黄耆甘草白术生干地黄当归牛膝黄精远志石菖