仁斋直指方论
序卷一风温温疫卷二暑温伏暑温毒湿温冬温卷三中风少阳螈肝风肝厥胁痛肝痈癫狂虚劳吐血便血肿胀单腹胀滞下（俗名痢疾，又曰积。红色属热，属血，白色属寒、属气。）积聚淋浊泄泻卷四痘症噎呕吐反胃哕失音水气寒湿痹风
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
序卷一杂症述略卷二妇科述略胎前论治卷三产后述略
序卷一金石部金银箔黄丹胡粉铜青铁浆铁锈水银轻粉银朱密陀僧丹砂钟乳矾石禹余粮硝石滑石石膏青盐食盐雄黄紫石英赤石脂寒水石花蕊石阳起石蓬砂胆矾青礞石无名异玉屑自然铜石燕磁石硫黄果部陈皮青皮枳壳枳实杏仁桃仁大
序一序二序三自序卷一草部黄甘草人参北沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝蒌实天花粉夏枯草昆布独活羌活防风本葛
张序卷首保产卷一禀赋脏能脉候胎病胎热胎寒胎肥胎怯胎黄胎惊锁肚不啼不乳脐风撮口噤口变蒸卷二杂症咽喉齿舌口耳目鼻囟颐脐语迟夜啼龟胸龟背鹤节行迟五软五硬卷三痘疮总诀卷四痘疮发热三日诀见点三日诀卷五痘疮起胀三
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下
明目论看眼诀图眼病歌诀冷眼歌诀热眼歌诀药性光明赋五经虚泻五经火眼目虚实冷热论点药药性炮炼法男女禁忌看眼法演药法点药法制药法煎膏法研药法合药法用药法服药法禁忌主药方辅药方加减方按五轮治疗捷法四季加减煎药
重雕宋本《卫生家宝产科备要》叙卷第二孙真人养胎论徐之才逐月养胎方妊娠一月妊娠二月妊娠三月妊娠四月妊娠五月妊娠六月妊娠七月妊娠八月妊娠九月妊娠十月卷第三论初妊娠论欲产并产后卷第四二十一论并增入十八论第一