《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
简介序卷一卷二卷三卷四
简介序上卷中卷下卷
序卷一风温温疫卷二暑温伏暑温毒湿温冬温卷三中风少阳螈肝风肝厥胁痛肝痈癫狂虚劳吐血便血肿胀单腹胀滞下（俗名痢疾，又曰积。红色属热，属血，白色属寒、属气。）积聚淋浊泄泻卷四痘症噎呕吐反胃哕失音水气寒湿痹风
自叙凡例卷一总论察色听声脉法脉应杂病看虎口三关法小儿指形图（十五幅）（图缺）初生诸病胎惊胎痫胎风胎黄胎寒胎热撮口鹅口（一名噤口风．又名雪口．）脐风脐湿肿脐疮脐突惊风惊搐由脏腑惊搐痫痉不同伤风伤食发搐惊
王序卷上第一节 经水第二节 月事不调第三节 辨色及病第四节 经行声哑及目暗泄泻带下等证第五节 月事不来第六节 淋漓不断第七节 月事异常第八节 血崩第九节 带下第十节 求子第十一节 受胎总论第十二节 辨
简介叙题辞序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八跋
序一、内科感冒风温春温暑温湿温伏暑秋燥冬温咳嗽喘证哮证痰证血证惊悸怔忡不寐遗精癫狂痫证中风眩晕厥证脱证痹证痿证脚气胃脘痛胁痛腹痛腹胀噎气呃逆呕吐霍乱泄泻痢疾便秘脱肛疟疾黄疸积聚水肿淋证疝气诸虚中毒发杂
初生沐浴噤风撮口脐风气闭啼伤风咳嗽疟吐吐泻霍乱积痢疳肿胀惊风惊风死症歌脉法慢惊慢脾风毒惊瘫鹤膝候痫腹痛虫心痛咽喉暑脱肛热黄胆淋症（附白尿）眼目赤肿痧疹
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一