一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
徐序鲍序卷上阳气阴气四气气相得则和不相得则病天符岁会六元正纪《灵》《素》不同《素问》传写之误《甲乙》之误王注之误心欲软肾欲坚三阳在头三阴在手脾气外绝劳风结阳结阴胃脘痈肠覃石瘕肺消四维相代四肢不举折髀水
鍼灸甲乙经
铜人针灸经点校说明卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
刘叙自叙凡例卷一多读书论脉位法天地五行论提纲论因形气以定诊论运气论太素脉论审象论脉有亢制论冲阳太二脉论脉有不可言传论脉无根有两说论调息已定然后诊脉论问情论卷二卷三浮脉（阳）沉脉（阴）迟脉（阴）数脉（阳
刘序凡例正面图（图缺）背面图（图缺）指节图灸盏图灸药神方人神在曰不宜灸单十二时人神所在不宜针灸歌十二支曰人神所在不宜针灸歌十干曰人神所在不宜针灸歌尻神图九宫尻神歌应灸七十症中风尸厥偏风眩晕痿症痹症劳伤
自序例言卷一禀赋源流总论摄养为本总论卷二阴阳脏腑总论卷三营卫经络总论卷四上四诊合参总论卷四下经解格阳关阴脉脉应四时阴阳脉候部位脉象辨病诊脉察色观形经脉应四时十二月五脏绝脉五脏脉象辨脉平病死旺之象辨平病
自序凡例卷一月经治月经病方卷二胎前治胎前病方秦氏世传逐月养胎方卷三小产治小产病方临产治临产病方附前人治临产效方卷四产后治产后病方卷五带下治滞下病方崩漏治崩漏病方附录前人治临产效方卷六妇女杂病治妇女杂病
序退思集类方歌注麻黄汤类麻黄汤麻黄加术汤麻黄杏仁甘草石膏汤麻黄杏仁薏苡甘草汤越脾汤越脾加术汤越脾加半夏汤大青龙汤小青龙汤小青龙加石膏汤甘草麻黄汤麻黄附子汤麻黄附子细辛汤麻黄连翘赤小豆汤麻黄升麻汤浓朴麻
自序卷一证治总论气血精神论升降出入论承制生化论虚实补泻论卷二上形气类三阴三阳名义一三阴三阳名义二三阴三阳名义三高骨大骨非一骨也三焦水道膀胱津液论饮入于胃游溢精气上输于脾脾气散精上归于肺通调水道下输膀胱