医巫闾子医贯序卷之一玄元肤论内经十二官论阴阳论五行论论五行各有五卷之二主客辨疑中风论王安道中风辨口眼 斜厥伤寒论温病论郁病论卷之三绛雪丹书血症论附方卷之四先天要论（上）八味丸方张仲景八味丸用泽泻论水火
徐序鲍序卷上阳气阴气四气气相得则和不相得则病天符岁会六元正纪《灵》《素》不同《素问》传写之误《甲乙》之误王注之误心欲软肾欲坚三阳在头三阴在手脾气外绝劳风结阳结阴胃脘痈肠覃石瘕肺消四维相代四肢不举折髀水
简介普济方有关说明卷一 方脉总论 辨男女形生神毓论卷二 方脉总论 辨奇经八脉法卷三 方脉总论 辨七表八里脉法卷四 方脉总论 九道病脉卷五 方脉药性总论 药性总论卷六 五运六气图卷七 运气图 甲子岁图卷
金匮要略方论序卷上藏府经络先后病脉证第一痉湿喝病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病
题辞卷上脏腑经络先后病脉证第一湿病脉证第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉证治第九腹满
卷一外治法手法总论手法释义器具总论经义击仆损伤应刺诸穴经义恶血已留复因怒伤肝经义击仆伤后入房伤脾经义击仆损伤脉色经义《灵枢经》骨度尺寸补遗卷二头面部巅顶骨囟骨山角骨凌云骨睛明骨两颧骨鼻梁骨中血堂唇口玉
房中补益
序一序二序三卷一卷二卷三疹痧疹附录吴山散记小引吴山散记
自序卷一证治总论气血精神论升降出入论承制生化论虚实补泻论卷二上形气类三阴三阳名义一三阴三阳名义二三阴三阳名义三高骨大骨非一骨也三焦水道膀胱津液论饮入于胃游溢精气上输于脾脾气散精上归于肺通调水道下输膀胱
本草乘雅半偈自序本草乘雅义例别录〔衍〕本草乘雅凡例乘雅半偈采录诸书大意第一帙紫芝青芝赤芝黄芝白芝黑芝人参甘草黄蓍实菟丝子莲实茯苓柏实云母丹砂菖蒲赤箭薯蓣干地黄枸杞菊花麦门冬太一余粮石钟乳龙骨蜂蜜第二帙