绪言第一卷温热总论论温热四时皆有（添加）论温热五种辨法论温热与风寒各异论温热伏气与新感不同（添加）论温热即是伏火（添加）论湿火之症治论燥火之症治论温热本症疗法（添加）论温热兼症疗法其一兼风其二兼寒其三
序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
简介自序凡例补养之剂第一发表之剂第二涌吐之剂第三攻里之剂第四表里之剂第五和解之剂第六理气之剂第七理血之剂第八祛风之剂第九祛寒之剂第十清暑之剂第十一利湿之剂第十二润燥之剂第十三泻火之剂第十四除痰之剂第十
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
自序新刻难经悬解叙卷上一难二难三难四难五难六难七难八难九难十难十一难十二难十三难十四难十五难十六难十七难十八难十九难二十难二十一难二十二难二十三难二十四难二十五难二十六难二十七难二十八难二十九难三十难
卷一风癞论受病所在经络三十六疯六经分属***风蛇皮风脱跟风鱼鳞风邪魅风血风鹅掌风鼓槌风血痹风糕风痛风癫风半肢风软瘫风紫云风干风干风干风白癜风蚝风历节风壁泥风疹风哑风冷麻风漏蹄风蛤蟆风核桃风水风热风雁来风
自序再自序合论诸书之得失以示初学之从违（四条）论读医书之难论诊病须知四诊论《景岳全书》论金匮肾气汤论倪涵初先生疟痢三方附录王子圣大归芍汤张洁古芍药汤附论噤口痢论吴又可《温疫论》（四条）论时邪论初诊用药
内容提要生理学合参卷一一、西医生理学脑血液皮肤消化器循环器呼吸器排泻器神经系五官器生殖器二、中医生理学五脏六腑此外病理学合参卷二一、热二、痛三、血四、呕吐五、谵语六、泻七、肿，胀八、汗九、头痛十、咳嗽
第一类植物类食疗方萝卜粥小麦粥马齿菜粥葛粉羹荆芥粥麻子粥恶实菜莲子粥鸡头粥葵菜羹生地黄粥生地黄粥酸枣粥桃仁粥椒面羹荜茇粥良姜粥吴茱萸粥炒黄面第二类动物类食疗方乳饼面生地黄鸡羊密膏羊脏羹羊骨粥羊脊骨羹白